Autores
M. Arroyo Varela, R. Larrosa Jiménez, R. Bautista Moreno, J.L. de la Cruz Ríos, M.A. Cobo Dols, M.G. Claros Díaz
Introducción
El cáncer de pulmón es el de mayor mortalidad y peor pronóstico con una escasa tasa de supervivencia. Su etiopatogenia es aún desconocida, lo que implica la necesidad de buscar nuevas opciones diagnóstico-terapéuticas, basadas en nuevos mecanismos implicados en su desarrollo. Los elementos móviles, también denominados transposones, son secuencias de ADN con capacidad de cambiar de posición en el genoma. Están involucradas en muchas enfermedades, entre las que se encuentra el cáncer. Nuestros objetivos son determinar la importancia de los transposones en el carcinoma epidermoide y adenocarcinoma de pulmón, conocer la regulación de la expresión en los tejidos sano y tumoral y conocer los transposones que se expresan diferencialmente entre ambos tejidos y en ambos cánceres para proponerlos como biomarcadores.
Metodología
Se ha secuenciado ARN total del tejido tumoral y sano adyacente de ocho pacientes intervenidos de cada tipo histológico. Se han analizado con un flujo de trabajo bioinformático específico, que conlleva preprocesar las lecturas, alinearlas al genoma humano de referencia, determinar la expresión de los transposones en cada una de las muestras, y calcular la expresión diferencial de los mismos al comparar el tejido sano y tumoral de cada paciente.
Resultados
Hemos demostrado que el nivel de transposición global no cambia entre el tejido sano y tumoral. Sin embargo, sí se han encontrado transposones con expresión diferencial significativa en cada uno de los tejidos estudiados. En el carcinoma epidermoide encontramos 12 transposones con expresión diferencial, de los que más del 60% de los expresados en tejido tumoral son del tipo ERV. En el adenocarcinoma aparecen 6 elementos móviles claramente diferentes que muestran un cambio de expresión estadísticamente significativo entre el tejido tumoral y sano en los pacientes analizados, la mayoría de tipo HERV. Además hemos comparado los resultados obtenidos en los pacientes con carcinoma epidermoide de pulmón de los pacientes con adenocarcinoma pulmonar encontrando que algunos de ellos coinciden en ambos tipos histológicos.
Conclusiones
Se han detectado elementos móviles, en su gran mayoría de tipo ERV, diferencialmente expresados entre el tejido tumoral y sano de los pacientes con ambos tipos de cáncer estudiados. De estos 12 elementos, 2 (HERVL 18-int y LTR18B) son comunes en ambos tipos tumorales, comportándose la expresión en el mismo sentido en ambos tipos de tumores.
Estudio realizado gracias a las Becas Neumosur 12/2015 y 14/2016.
