Autores
M. Arroyo Varela, R. Bautista Moreno, R. Larrosa Jiménez, J.L. de la Cruz Ríos, M.A. Cobo Dols, M.G. Claros Díaz
Introducción
Se conoce que los transposones están involucrados en muchas enfermedades, entre las que se incluye el cáncer. Estudiar su regulación tras un cambio oncogénico podría ayudar en la búsqueda de nuevos biomarcadores.
Metodología
Hemos obtenido de bases de datos públicas de RNA-seq muestras sanas y tumorales, de los mismos pacientes, en dos tipos histológicos distintos de cáncer de pulmón, adenocarcinoma y carcinoma microcítico. Se han analizado con un flujo de trabajo bioinformático desarrollado en nuestro laboratorio y hemos obtenido los transposones que se expresan diferencialmente entre tejido sano y tumoral de ambos tipos de tumores. Los transposones diferencialmente expresados que han tenido un comportamiento similar en todos los pacientes han sido posteriormente confirmados con una nueva cohorte de pacientes intervenidos en el Hospital Regional de Málaga.
Resultados
Hemos confirmado que existe una reprogramación específica de transposones, en vez de una desregulación global. Hemos encontrado transposones diferencialmente expresados para adenocarcinoma de pulmón, carcinoma microcítico de pulmón y para ambos cánceres. Muchos de ellos son elementos HERV, mientras que sólo unos pocos son LINEs. La represión de los transposones AluYg6 y LTR18B fueron los biomarcadores confirmados para cáncer de pulmón y UCON88 y HERVK11D-Int como biomarcadores específicos sobreexpresados en ambos tipos de cáncer de pulmón.
Conclusiones
La reprogramación estricta de los transposones tras un proceso oncogénico podría ser otra característica que influya en la supervivencia del cáncer, haciendo de la expresión diferencial de los transposones una fuente prometedora de biomarcadores teranósticos para el cáncer de pulmón.
Estudio realizado gracias a la beca de Neumosur 12/2015.
